1999年卫生部颁发了《关于对HIV感染者和艾滋病病人的管理意见》，规定由地方各级人民政府负责对HIV感染者和艾滋病病人管理的统一领导。采取加强医疗照顾与提供社区服务及鼓励社会与家庭关怀相结合的方式，对HIV感染者和艾滋病病人进行管理。对HIV感染者和艾滋病病人主要在社区进行管理，要为他们营造一个友善、理解、健康的生活环境。
规定要求各级卫生行政部门应指定医疗机构为HIV感染者和艾滋病病人提供医疗服务。被指定的医疗机构必须及时收治就诊的HIV感染者和艾滋病病人，并应及时安排医务人员为其进行疾病的诊治，不得拒绝。并要为病人保密，不得歧视病人。可设立家庭病床，定期随访并给予家庭护理指导。
各部门及社会团体和有关人员应关心HIV感染者和艾滋病病人。
属于被拘留、劳改、劳教和羁押的HIV感染者应在其关押收容场所内接受管理教育。对已出现临床症状的感染者，经当地卫生行政部门指定的医学专家确诊为艾滋病病人，而关押场所内又无条件隔离治疗的，可保外就医。
流动人口中被确诊的HIV感染者和艾滋病病人，原则上由现住地负责对其监护管理，没有正当理由，不得将HIV感染者和艾滋病病人遣送回原籍。
《关于对HIV感染者和艾滋病病人的管理意见》还对疫情的发现、报告、管理、HIV感染者和艾滋病病人的权利、义务与责任以及回国人员、来华境外人员HIV感染者和艾滋病病人的管理进行了规定。
